Имеет ли право на зачет сумм НДС головная организация если ЭСФ выписан в адрес филиала?

Комитет государственных доходов Министерства финансов Республики Казахстан (далее – КГД МФ РК) рассмотрев Ваш вопрос, поступивший на блог Председателя КГД МФ РК сообщает следующее.
В соответствии с пунктом 3 статьи 412 Кодекса Республики Казахстан «О налогах и других обязательных платежах в бюджет» (Налоговый кодекс) счет-фактура в электронной форме (далее – ЭСФ) выписывается в информационной системе ЭСФ в порядке и по форме, которые определены уполномоченным органом. Согласно пункту 8 статьи 412 Налогового кодекса в случае, если от имени юридического лица в качестве поставщика товаров, работ, услуг выступает его структурное подразделение и по решению юридического лица выписка счетов-фактур производится таким структурным подразделением, а также в случае, если от имени юридического лица структурное подразделение выступает получателем товаров, работ, услуг, в целях выполнения:
1) требований, установленных подпунктами 3) и 5) пункта 5 данной статьи, в счете-фактуре допускается указание реквизитов структурного подразделения юридического лица;
2) требования, установленного подпунктом 2) пункта 5 данной статьи, в счете-фактуре указывается идентификационный номер юридического лица.
При этом в случае указания реквизитов структурного подразделения юридического лица в соответствии с подпунктом 1) данного пункта указывается идентификационный номер такого структурного подразделения. В соответствии с подпунктами 1) и 2) пункта 44 Правил выписки счета-фактуры в электронной форме в информационной системе электронных счетов-фактур, утвержденных приказом Первого Заместителя Премьер-Министра Республики Казахстан - Министра финансов Республики Казахстан от 22 апреля 2019 года №370 (далее – Правила),
В разделе С «Реквизиты получателя» в строке 16 «ИИН/БИН» указываются индивидуальный идентификационный номер (далее – ИИН) или бизнес-идентификационный номер (далее – БИН) получателя товаров, работ, услуг, а в строке 16.0 «БИН структурного подразделения юридического лица» указывается БИН структурного подразделения юридического лица получателя товаров, работ, услуг или БИН ликвидированного структурного подразделения юридического лица. Согласно части второй подпункта 4) пункта 44 Правил в строке 17 «Получатель» указывается наименование получателя товаров, работ, услуг в отношении юридических лиц (структурных подразделений юридического лица), являющихся получателями товаров, работ, услуг, – наименование, указанное в справке о государственной регистрации (перерегистрации) юридического лица (структурного подразделения юридического лица). При этом в части указания организационно-правовой формы возможно использование аббревиатуры в соответствии с обычаями, в том числе обычаями делового оборота.
В тоже время, в информационной системе ЭСФ предусмотрено два способа выписки ЭСФ:
1) в адрес головной организации - в строке 16 указывается БИН головной организации, а в строке 16.0 БИН структурного подразделения юридического лица-резидента;
2) в адрес структурного подразделения юридического лица-резидента - в строке 16 указывается БИН структурного подразделения юридического лица-резидента, а строка 16.0 не заполняется.
Таким образом, если из условий договора следует, что получателем товаров, работ, услуг является структурное подразделение юридического лица, и по решению головной организации, структурное подразделение юридического лица-резидента, может выступать получателем товаров, работ, услуг по выписанным ЭСФ как в адрес головной организации, так и в адрес структурного подразделения юридического лица-резидента с учетом положений пункта 8 статьи 412 Налогового кодекса.
Соответственно, при соблюдении указанных условий, и положений статьи 400 Налогового кодекса, сумма НДС по такому счету-фактуре подлежит отнесению в зачет.

Председатель Комитета государственных доходов МФ РК,
Султангазиев М.Е. 26.01.2021