Как оформить утилизацию товаров и оформление дополнительного счет-фактуры?

ТОО работает по ОУР, плательщик НДС. В 2016 году заключили договор о поставке товара под реализацию, товар был поставлен на сумму 25 000 000 тенге , в середине 2016 года сертификат на товар отозван и покупатель произвел возврат на не проданный/реализованный товар. За реализованный товар оплата произведена в сумме 16 000000 тенге, при возврате товара в возвратных накладных не правильно отражено количество товара.
На основании не правильного отражения количества товара произошло не согласие между компаниями, не выписан минусовый счет фактура на сумму 6.000000 тенге. В связи с отозванным сертификатом в одностороннем порядке произведено уничтожение товара покупателем на сумму 3 000 000 тг (акт уничтожения имеется).
1. Как списать уничтоженный товар?
2. Надо ли выписывать минусовую счет-фактуру, каким периодом, чтобы учитывать возвратную сумму НДС в декларации ф.300.00?
3. Можем ли выписать минусовые с/ф на бумажном носителе и произвести корректировку НДС и КПН в 2016г или 2017г?
4. Чем это чревато?