Как урегулировать данные по виртуальным складам?

Приняли ТОО (общеустановленный режим, с НДС) с лицензиями на алкогольную продукцию опт, в ходе проверки оказалось, что есть документы не отраженные в СНА, но имеющие ЭСФ, и наоборот. Так же есть путаница по внутреннему перемещению между лицензиями, соответственно ошибки в алкодекларантах. Продажи так же есть не корректные (не с той лицензии). Вопрос, в связи с тем, что необходимо подготовить склады к переходу на виртуальные остатки, каким способом можно их откорректировать и какими документами, а так же каковы последствия? Данные проверялись с 2018 по 2020 года.